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- Il cammino dell’evoluzione umana, Jaca Book, Milano (I ed. 1985; II ed. 1994), volume tradotto in lingua croata.

- Antropologia (Evoluzione, Uomo, Ambiente). Utet, Torino, pp.600 ( I ed. 1988; II ed. 1995).

- L’Uomo. Introduzione alla Paleoantropologia (con prefazione di Yves Coppens), Jaca Book, Milano, 1990. E’ stato tradotto in francese, spagnolo, tedesco, giapponese.

- La religiosità nella preistoria (in coll. con B. Vandermeersch, J. Kozlowsky, M. Gimbutas), Jaca Book, Milano, 1991 (tradotto in lingua croata).

- Premesse per una Paleoantropologia culturale. Jaca Book, Milano, 1992.

- Paleoantropologia e Preistoria. Dizionario enciclopedico (in coll, con A,.Beltran e A. Broglio) (con oltre 800 voci e contributi originali di studiosi italiani e stranieri). Jaca Book, Milano, 1993.

- The first humans and their cultural manifestations (Ed. by), Colloquia VII and VIII XIII Intern. Congress UISPP, Forlì 8-14 sept. 1996. Ed. Abaco, Forlì.

- Evoluzione umana e cultura. Ed. La Scuola, Brescia, 1999.

- Miti e riti della preistoria. (in coll. con P. Magnani), Jaca Book, Milano, 2000.

- Scienza e conoscenza verso un nuovo umanesimo (a cura di), Atti del Convegno internazionale su “Scienza e conoscenza: verso quale razionalità?”, Ed. Compositori, Bologna, 2000.

- Origini dell’uomo ed evoluzione culturale. Profili scientifici, filosofici, religiosi. Ed. Jaca Book, Milano, 2002.

- Un ambiente per l’uomo (a cura di ), Edizioni Dehoniane, Bologna, 2005.

- E l’uomo venne sulla terra. Ed. S.Paolo, Cinisello Balsamo, 2005. (tradotto in lingua spagnola)

- Le origini dell’uomo e l’evoluzione culturale. Jaca Book, Milano, 2006. (tradotto in lingua francese, tedesca, croata, spagnola, olandese).

- L’avventura dell’uomo. Ed. S.Paolo, Cinisello Balsamo, 2006.

- Le sfide dell’evoluzione. In armonia tra scienza e fede. Jaca Book , Milano, 2008. (Trad. francese "Les defis de l'evolution. Harmonie entre science et foi", Edition Parole et silence, 2009, Paris, prefazione di Mgr Gianfranco Ravasi)

- Popoli della Yurta. Kazakhstan tra le origini e la modernità (a cura di), Jaca Book, Milano, 2008.

- La lunga storia di Neandertal (a cura di Giovanna Belcastro e Fiorenzo Facchini), Jaca Book, Milano, 2009.

- Complessità, evoluzione, uomo (a cura di), Jaca Book, Milano, 2011.

- Evoluzione. Cinque questioni nel dibattito attuale (con prefazione di Yves Coppens), Jaca Book, Milano, 2012.

- Persona, Comunità, Servizio : la testimonianza di Madeleine Delbrel (a cura di), Elledici, Torino, 2012.

- Sperare sempre. Barbara Ferrari. 14 anni di vita in coma (a cura di Fiorenzo Facchini e Gianluigi Poggi), Dehoniana Libri, Bologna, 2012.

- L'amore basta? Famiglia e persone in stato vegetativo (a cura di Fiorenzo Facchini e Gianluigi Poggi), Dehoniana Libri, Bologna, 2014.

- Natura e cultura nella questione del "genere" (a cura di Fiorenzo Facchini), Ed. Dehoniane, Bologna, 2015.

- Sviluppo dell'affettività e cultura del "genere" (a cura di Fiorenzo Facchini), Ed. Dehoniane, Bologna, 2016.

- Sessualità e genere : si può scegliere?, Elledici, Torino, 2016.

Per la divulgazione scientifica per ragazzi ha curato quattro volumi per l’editrice Jaca Book: Una giornata con Homo habilis; Una giornata con Homo erectus; Una giornata con i Neandertaliani; Una giornata con Homo sapiens (Jaca Book, Milano, 2002-2003) tradotti in lingua francese e inglese.